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科技效果/猪遗传育种科技创新团队研究获得高质量猪基因组结构变异图谱

时间:2023-12-7 10:35:39

泉源:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 作者: 张龙超 

克日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所猪遗传育种科技创新团队在猪基因组结构变异研究中取得希望。gai研究通过整合多个结构变异软件的性能,乐成获得含有123151个结构变异的高质量猪基因组结构变异图谱。相关效果揭晓在《动物科学与生物手艺杂志(Journal of animal science and biotechnology)》上。
  据团队执行首席张龙超研究yuan先容,基因组重排会发生大量的结构变异,只管这些变异主要发生在非编码区,但效果变异会通过剂量效应调控基因的表达。而且,与SNP相比,结构变异在重大表型中所占比例更高。现在,结构变异已被以为是影响基因组进化和功效的主要突变实力。近年来,只管已有一些关于猪基因组结构变异的研究报道,但基于结构变异的全基因组关联研究却鲜有报道,这限制了尊龙凯时·(中国)首页对结构变异作为遗传标志的潜在功效以及使用的明确。
  研究团队以自主构建的明确猪和民猪资源群体为研究工具,通过使用高笼罩率的F0个体并团结多个结构变异工具举行剖析,获得了包罗123151个结构变异的高质量图谱,其中53.95%的结构变异为首ci获得。这些高质量的结构变异被用于恢复种群结构,证实了基因分型的准确性。然后凭证位置效应和品种分化确定了大量潜在的结构变异功效位点。最后,使用在F0个体中筛选出的潜在因果位点在子女群体(F2)中响应的基因组位置举行基因分型,对36个性状举行了全基因组关联研究,发现结构变异主要涉及骨骼巨细相关的性状,与肉质性状和其他一些胴体性状关联度较差,推测结构变异可能与欧亚猪种之间的体型差异有关。


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